Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRAF1Q13077 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF1Q13077 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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