Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSTF3Q12996 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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