Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
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