Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SYCNQ0VAF6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms