Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD47Q08722 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD47Q08722 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms