Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNEQ04844 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms