Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PLCB3Q01970 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms