Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms