Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLTCQ00610 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms