Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAE1P78406 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAE1P78406 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAE1P78406 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAE1P78406 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAE1P78406 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms