Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms