Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LUMP51884 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LUMP51884 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LUMP51884 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LUMP51884 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms