Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP9P49458 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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