Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALDH9A1P49189 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms