Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT5P48643 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT5P48643 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT5P48643 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT5P48643 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT5P48643 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCT5P48643 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT5P48643 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT5P48643 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms