Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms