Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms