Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA10P31260 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms