Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGB2P26583 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB2P26583 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms