Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB3P16520 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms