Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms