Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NGFRP08138 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NGFRP08138 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms