Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-AP01891 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms