Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5O75197 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5O75197 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5O75197 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5O75197 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms