Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN6O00399 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms