Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms