Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD3A6NKT7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD3A6NKT7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms