Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00312Q9Y6C7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms