Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4BQ9Y4P1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms