Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDARQ9UNE0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDARQ9UNE0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms