Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
INO80Q9ULG1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms