Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms