Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NINJ2Q9NZG7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms