Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG3Q9NT62 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG3Q9NT62 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms