Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ASCL3Q9NQ33 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms