Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms