Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRIP1Q9BX63 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms