Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A3Q9BRY0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms