Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms