Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms