Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARXQ96QS3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms