Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCGB3A2Q96PL1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms