Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC59Q96AG4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC59Q96AG4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms