Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms