Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID2Q8N945 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID2Q8N945 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID2Q8N945 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID2Q8N945 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID2Q8N945 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID2Q8N945 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID2Q8N945 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID2Q8N945 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms