Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTBP4Q8N2S1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms