Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME9Q86XW9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms