Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HECW1Q76N89 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HECW1Q76N89 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms