Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM47EQ6ZV65 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms