Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WDR88Q6ZMY6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms